Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GNB1P62873 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GNB1P62873 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GNB1P62873 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GNB1P62873 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GNB1P62873 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GNB1P62873 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GNB1P62873 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GNB1P62873 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GNB1P62873 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GNB1P62873 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GNB1P62873 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GNB1P62873 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GNB1P62873 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GNB1P62873 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GNB1P62873 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GNB1P62873 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GNB1P62873 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GNB1P62873 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GNB1P62873 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GNB1P62873 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GNB1P62873 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GNB1P62873 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GNB1P62873 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GNB1P62873 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GNB1P62873 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GNB1P62873 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GNB1P62873 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GNB1P62873 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GNB1P62873 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GNB1P62873 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GNB1P62873 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GNB1P62873 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB1P62873 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB1P62873 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB1P62873 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB1P62873 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB1P62873 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB1P62873 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GNB1P62873 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GNB1P62873 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNB1P62873 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNB1P62873 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNB1P62873 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNB1P62873 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB1P62873 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB1P62873 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB1P62873 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB1P62873 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB1P62873 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB1P62873 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNB1P62873 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNB1P62873 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GNB1P62873 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GNB1P62873 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB1P62873 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB1P62873 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB1P62873 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB1P62873 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB1P62873 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB1P62873 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB1P62873 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB1P62873 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB1P62873 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB1P62873 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB1P62873 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB1P62873 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB1P62873 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB1P62873 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB1P62873 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB1P62873 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB1P62873 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB1P62873 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB1P62873 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB1P62873 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB1P62873 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB1P62873 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB1P62873 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB1P62873 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB1P62873 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB1P62873 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB1P62873 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB1P62873 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB1P62873 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB1P62873 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB1P62873 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB1P62873 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB1P62873 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GNB1P62873 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GNB1P62873 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GNB1P62873 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GNB1P62873 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GNB1P62873 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GNB1P62873 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GNB1P62873 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GNB1P62873 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GNB1P62873 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB1P62873 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB1P62873 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB1P62873 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms