Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB15P59190 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB15P59190 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB15P59190 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB15P59190 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB15P59190 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB15P59190 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB15P59190 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB15P59190 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB15P59190 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB15P59190 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB15P59190 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB15P59190 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB15P59190 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB15P59190 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB15P59190 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB15P59190 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB15P59190 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB15P59190 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB15P59190 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB15P59190 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB15P59190 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB15P59190 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB15P59190 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB15P59190 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB15P59190 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB15P59190 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB15P59190 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB15P59190 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB15P59190 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB15P59190 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB15P59190 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB15P59190 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB15P59190 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB15P59190 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB15P59190 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB15P59190 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB15P59190 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB15P59190 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB15P59190 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB15P59190 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB15P59190 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB15P59190 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB15P59190 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB15P59190 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB15P59190 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB15P59190 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB15P59190 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB15P59190 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB15P59190 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB15P59190 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB15P59190 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB15P59190 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB15P59190 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB15P59190 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB15P59190 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB15P59190 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB15P59190 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB15P59190 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB15P59190 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB15P59190 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB15P59190 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB15P59190 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB15P59190 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB15P59190 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB15P59190 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB15P59190 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB15P59190 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB15P59190 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB15P59190 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB15P59190 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB15P59190 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB15P59190 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB15P59190 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB15P59190 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB15P59190 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB15P59190 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB15P59190 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB15P59190 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB15P59190 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB15P59190 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB15P59190 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB15P59190 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB15P59190 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB15P59190 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB15P59190 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB15P59190 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB15P59190 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB15P59190 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB15P59190 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB15P59190 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB15P59190 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB15P59190 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB15P59190 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB15P59190 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB15P59190 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB15P59190 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB15P59190 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB15P59190 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB15P59190 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms