Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RP1P56715 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RP1P56715 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RP1P56715 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RP1P56715 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RP1P56715 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RP1P56715 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RP1P56715 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RP1P56715 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RP1P56715 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RP1P56715 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RP1P56715 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RP1P56715 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RP1P56715 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RP1P56715 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RP1P56715 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RP1P56715 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RP1P56715 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RP1P56715 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RP1P56715 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RP1P56715 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RP1P56715 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RP1P56715 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RP1P56715 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RP1P56715 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RP1P56715 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RP1P56715 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RP1P56715 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RP1P56715 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RP1P56715 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RP1P56715 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RP1P56715 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RP1P56715 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RP1P56715 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RP1P56715 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RP1P56715 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RP1P56715 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RP1P56715 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RP1P56715 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RP1P56715 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RP1P56715 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RP1P56715 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RP1P56715 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RP1P56715 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RP1P56715 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RP1P56715 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RP1P56715 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RP1P56715 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RP1P56715 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RP1P56715 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RP1P56715 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RP1P56715 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RP1P56715 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RP1P56715 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RP1P56715 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP1P56715 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP1P56715 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP1P56715 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP1P56715 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP1P56715 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RP1P56715 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP1P56715 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RP1P56715 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RP1P56715 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RP1P56715 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RP1P56715 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RP1P56715 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RP1P56715 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RP1P56715 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RP1P56715 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RP1P56715 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RP1P56715 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RP1P56715 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP1P56715 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP1P56715 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP1P56715 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP1P56715 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP1P56715 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP1P56715 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP1P56715 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP1P56715 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP1P56715 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP1P56715 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RP1P56715 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RP1P56715 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RP1P56715 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RP1P56715 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RP1P56715 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RP1P56715 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RP1P56715 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RP1P56715 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RP1P56715 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RP1P56715 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RP1P56715 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RP1P56715 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RP1P56715 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RP1P56715 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RP1P56715 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RP1P56715 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RP1P56715 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.6 ms