Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTEP56180 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTEP56180 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTEP56180 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTEP56180 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTEP56180 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTEP56180 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTEP56180 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTEP56180 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTEP56180 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTEP56180 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTEP56180 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTEP56180 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTEP56180 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTEP56180 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPTEP56180 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPTEP56180 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPTEP56180 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPTEP56180 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPTEP56180 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPTEP56180 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPTEP56180 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPTEP56180 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPTEP56180 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPTEP56180 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPTEP56180 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPTEP56180 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPTEP56180 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPTEP56180 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPTEP56180 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPTEP56180 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPTEP56180 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPTEP56180 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPTEP56180 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPTEP56180 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPTEP56180 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPTEP56180 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPTEP56180 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPTEP56180 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPTEP56180 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPTEP56180 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPTEP56180 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPTEP56180 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPTEP56180 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPTEP56180 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPTEP56180 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPTEP56180 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPTEP56180 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPTEP56180 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPTEP56180 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TPTEP56180 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPTEP56180 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPTEP56180 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPTEP56180 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPTEP56180 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPTEP56180 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPTEP56180 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPTEP56180 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPTEP56180 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPTEP56180 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPTEP56180 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPTEP56180 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPTEP56180 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPTEP56180 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPTEP56180 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPTEP56180 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPTEP56180 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPTEP56180 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPTEP56180 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TPTEP56180 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPTEP56180 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPTEP56180 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPTEP56180 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPTEP56180 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPTEP56180 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPTEP56180 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPTEP56180 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPTEP56180 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPTEP56180 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPTEP56180 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPTEP56180 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPTEP56180 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPTEP56180 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPTEP56180 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TPTEP56180 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPTEP56180 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPTEP56180 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPTEP56180 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPTEP56180 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPTEP56180 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPTEP56180 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPTEP56180 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPTEP56180 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPTEP56180 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPTEP56180 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPTEP56180 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPTEP56180 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPTEP56180 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPTEP56180 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPTEP56180 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms