Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNU13P55769 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNU13P55769 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNU13P55769 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNU13P55769 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNU13P55769 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNU13P55769 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNU13P55769 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNU13P55769 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNU13P55769 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNU13P55769 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNU13P55769 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNU13P55769 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNU13P55769 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNU13P55769 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNU13P55769 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNU13P55769 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNU13P55769 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNU13P55769 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNU13P55769 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNU13P55769 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNU13P55769 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNU13P55769 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNU13P55769 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNU13P55769 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNU13P55769 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNU13P55769 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNU13P55769 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNU13P55769 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNU13P55769 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNU13P55769 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNU13P55769 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNU13P55769 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNU13P55769 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNU13P55769 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNU13P55769 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNU13P55769 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNU13P55769 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNU13P55769 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNU13P55769 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNU13P55769 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNU13P55769 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNU13P55769 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNU13P55769 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNU13P55769 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNU13P55769 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNU13P55769 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNU13P55769 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNU13P55769 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNU13P55769 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNU13P55769 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNU13P55769 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNU13P55769 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNU13P55769 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNU13P55769 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNU13P55769 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNU13P55769 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNU13P55769 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNU13P55769 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNU13P55769 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNU13P55769 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNU13P55769 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNU13P55769 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNU13P55769 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNU13P55769 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNU13P55769 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNU13P55769 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNU13P55769 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNU13P55769 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNU13P55769 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNU13P55769 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNU13P55769 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNU13P55769 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNU13P55769 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNU13P55769 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNU13P55769 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNU13P55769 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNU13P55769 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNU13P55769 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNU13P55769 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNU13P55769 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNU13P55769 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNU13P55769 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNU13P55769 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNU13P55769 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNU13P55769 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNU13P55769 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNU13P55769 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNU13P55769 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNU13P55769 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNU13P55769 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNU13P55769 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNU13P55769 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNU13P55769 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNU13P55769 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNU13P55769 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNU13P55769 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNU13P55769 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNU13P55769 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNU13P55769 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms