Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NUP98P52948 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NUP98P52948 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUP98P52948 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUP98P52948 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUP98P52948 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUP98P52948 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NUP98P52948 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NUP98P52948 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NUP98P52948 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
NUP98P52948 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NUP98P52948 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NUP98P52948 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
NUP98P52948 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NUP98P52948 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NUP98P52948 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP98P52948 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP98P52948 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP98P52948 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP98P52948 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUP98P52948 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP98P52948 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP98P52948 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP98P52948 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NUP98P52948 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NUP98P52948 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NUP98P52948 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
NUP98P52948 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUP98P52948 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NUP98P52948 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP98P52948 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP98P52948 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP98P52948 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP98P52948 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP98P52948 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP98P52948 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP98P52948 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP98P52948 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP98P52948 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP98P52948 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP98P52948 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP98P52948 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NUP98P52948 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUP98P52948 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUP98P52948 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUP98P52948 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP98P52948 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP98P52948 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP98P52948 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP98P52948 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP98P52948 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP98P52948 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP98P52948 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP98P52948 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP98P52948 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP98P52948 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP98P52948 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP98P52948 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP98P52948 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP98P52948 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP98P52948 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP98P52948 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP98P52948 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP98P52948 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP98P52948 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP98P52948 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP98P52948 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUP98P52948 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NUP98P52948 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NUP98P52948 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NUP98P52948 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NUP98P52948 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP98P52948 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP98P52948 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP98P52948 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP98P52948 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP98P52948 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP98P52948 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP98P52948 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP98P52948 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP98P52948 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP98P52948 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP98P52948 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP98P52948 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP98P52948 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP98P52948 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUP98P52948 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUP98P52948 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUP98P52948 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUP98P52948 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUP98P52948 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP98P52948 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP98P52948 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP98P52948 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP98P52948 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP98P52948 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUP98P52948 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP98P52948 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP98P52948 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP98P52948 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms