Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMSP52788 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMSP52788 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMSP52788 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMSP52788 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMSP52788 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMSP52788 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMSP52788 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMSP52788 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMSP52788 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMSP52788 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMSP52788 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMSP52788 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMSP52788 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMSP52788 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMSP52788 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMSP52788 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMSP52788 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMSP52788 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMSP52788 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMSP52788 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMSP52788 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMSP52788 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SMSP52788 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMSP52788 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMSP52788 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMSP52788 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMSP52788 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMSP52788 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMSP52788 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMSP52788 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SMSP52788 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMSP52788 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SMSP52788 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMSP52788 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMSP52788 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMSP52788 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMSP52788 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMSP52788 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMSP52788 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMSP52788 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMSP52788 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMSP52788 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMSP52788 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMSP52788 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMSP52788 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMSP52788 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMSP52788 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMSP52788 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMSP52788 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMSP52788 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMSP52788 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMSP52788 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMSP52788 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMSP52788 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMSP52788 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMSP52788 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMSP52788 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMSP52788 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMSP52788 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMSP52788 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMSP52788 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMSP52788 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMSP52788 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMSP52788 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMSP52788 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMSP52788 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMSP52788 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMSP52788 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMSP52788 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMSP52788 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMSP52788 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMSP52788 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMSP52788 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMSP52788 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMSP52788 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMSP52788 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMSP52788 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMSP52788 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMSP52788 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMSP52788 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMSP52788 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMSP52788 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMSP52788 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMSP52788 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMSP52788 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMSP52788 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMSP52788 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMSP52788 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMSP52788 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SMSP52788 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMSP52788 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMSP52788 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMSP52788 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMSP52788 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMSP52788 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMSP52788 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMSP52788 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMSP52788 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMSP52788 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms