Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF143P52747 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF143P52747 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF143P52747 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF143P52747 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZNF143P52747 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF143P52747 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF143P52747 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF143P52747 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF143P52747 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF143P52747 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF143P52747 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms