Protein–RNA interactions for Protein: P51788

CLCN2, Chloride channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN2P51788 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN2P51788 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN2P51788 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN2P51788 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLCN2P51788 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 457.4 ms