Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARRES1P49788 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RARRES1P49788 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RARRES1P49788 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARRES1P49788 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.3 ms