Protein–RNA interactions for Protein: P49593

PPM1F, Protein phosphatase 1F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1FP49593 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPM1FP49593 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPM1FP49593 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPM1FP49593 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPM1FP49593 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPM1FP49593 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPM1FP49593 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPM1FP49593 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPM1FP49593 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPM1FP49593 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPM1FP49593 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPM1FP49593 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPM1FP49593 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPM1FP49593 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPM1FP49593 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPM1FP49593 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPM1FP49593 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPM1FP49593 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPM1FP49593 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPM1FP49593 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPM1FP49593 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPM1FP49593 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPM1FP49593 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPM1FP49593 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms