Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1A1P48729 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1A1P48729 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1A1P48729 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1A1P48729 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1A1P48729 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1A1P48729 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1A1P48729 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1A1P48729 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms