Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PIP4K2AP48426 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PIP4K2AP48426 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms