Protein–RNA interactions for Protein: P46977

STT3A, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STT3AP46977 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STT3AP46977 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STT3AP46977 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STT3AP46977 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STT3AP46977 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STT3AP46977 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STT3AP46977 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STT3AP46977 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STT3AP46977 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STT3AP46977 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STT3AP46977 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STT3AP46977 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STT3AP46977 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STT3AP46977 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STT3AP46977 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STT3AP46977 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STT3AP46977 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
STT3AP46977 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STT3AP46977 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STT3AP46977 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STT3AP46977 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STT3AP46977 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STT3AP46977 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STT3AP46977 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STT3AP46977 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STT3AP46977 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STT3AP46977 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STT3AP46977 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STT3AP46977 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STT3AP46977 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STT3AP46977 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STT3AP46977 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STT3AP46977 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STT3AP46977 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STT3AP46977 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STT3AP46977 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STT3AP46977 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STT3AP46977 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STT3AP46977 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STT3AP46977 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STT3AP46977 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STT3AP46977 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STT3AP46977 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STT3AP46977 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STT3AP46977 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STT3AP46977 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STT3AP46977 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STT3AP46977 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STT3AP46977 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STT3AP46977 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STT3AP46977 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STT3AP46977 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STT3AP46977 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STT3AP46977 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STT3AP46977 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STT3AP46977 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STT3AP46977 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STT3AP46977 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STT3AP46977 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STT3AP46977 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STT3AP46977 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STT3AP46977 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STT3AP46977 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STT3AP46977 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STT3AP46977 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STT3AP46977 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STT3AP46977 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STT3AP46977 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STT3AP46977 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STT3AP46977 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STT3AP46977 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STT3AP46977 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STT3AP46977 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STT3AP46977 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STT3AP46977 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STT3AP46977 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STT3AP46977 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STT3AP46977 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STT3AP46977 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STT3AP46977 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STT3AP46977 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STT3AP46977 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STT3AP46977 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STT3AP46977 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STT3AP46977 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STT3AP46977 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STT3AP46977 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STT3AP46977 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STT3AP46977 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STT3AP46977 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STT3AP46977 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STT3AP46977 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STT3AP46977 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STT3AP46977 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STT3AP46977 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STT3AP46977 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STT3AP46977 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STT3AP46977 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STT3AP46977 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STT3AP46977 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms