Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRXP46100 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRXP46100 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATRXP46100 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRXP46100 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRXP46100 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRXP46100 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATRXP46100 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATRXP46100 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRXP46100 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRXP46100 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATRXP46100 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATRXP46100 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATRXP46100 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATRXP46100 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATRXP46100 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRXP46100 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRXP46100 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRXP46100 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRXP46100 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRXP46100 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRXP46100 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRXP46100 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRXP46100 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRXP46100 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRXP46100 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATRXP46100 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRXP46100 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRXP46100 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRXP46100 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRXP46100 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRXP46100 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRXP46100 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRXP46100 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRXP46100 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRXP46100 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRXP46100 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRXP46100 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRXP46100 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRXP46100 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRXP46100 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRXP46100 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRXP46100 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRXP46100 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRXP46100 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRXP46100 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRXP46100 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRXP46100 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRXP46100 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRXP46100 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRXP46100 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRXP46100 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRXP46100 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATRXP46100 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATRXP46100 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRXP46100 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRXP46100 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRXP46100 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRXP46100 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRXP46100 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRXP46100 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRXP46100 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRXP46100 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRXP46100 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRXP46100 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRXP46100 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRXP46100 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRXP46100 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRXP46100 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRXP46100 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRXP46100 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATRXP46100 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRXP46100 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRXP46100 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATRXP46100 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATRXP46100 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRXP46100 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRXP46100 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRXP46100 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRXP46100 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRXP46100 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRXP46100 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRXP46100 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATRXP46100 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRXP46100 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRXP46100 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRXP46100 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRXP46100 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRXP46100 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRXP46100 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRXP46100 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRXP46100 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRXP46100 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRXP46100 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATRXP46100 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATRXP46100 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATRXP46100 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRXP46100 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRXP46100 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRXP46100 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms