Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNT3P45378 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TNNT3P45378 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNT3P45378 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms