Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP3P42574 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP3P42574 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP3P42574 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP3P42574 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP3P42574 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP3P42574 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP3P42574 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP3P42574 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP3P42574 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP3P42574 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP3P42574 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP3P42574 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP3P42574 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP3P42574 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP3P42574 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP3P42574 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP3P42574 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP3P42574 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP3P42574 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP3P42574 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP3P42574 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP3P42574 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP3P42574 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP3P42574 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP3P42574 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP3P42574 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP3P42574 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP3P42574 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP3P42574 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP3P42574 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP3P42574 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP3P42574 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP3P42574 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP3P42574 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP3P42574 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP3P42574 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP3P42574 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASP3P42574 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP3P42574 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP3P42574 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP3P42574 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP3P42574 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP3P42574 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP3P42574 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP3P42574 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP3P42574 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP3P42574 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP3P42574 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP3P42574 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP3P42574 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP3P42574 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP3P42574 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP3P42574 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP3P42574 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP3P42574 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP3P42574 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP3P42574 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP3P42574 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP3P42574 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP3P42574 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP3P42574 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP3P42574 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP3P42574 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP3P42574 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP3P42574 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP3P42574 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP3P42574 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP3P42574 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP3P42574 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP3P42574 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP3P42574 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP3P42574 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP3P42574 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP3P42574 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP3P42574 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP3P42574 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP3P42574 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP3P42574 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP3P42574 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP3P42574 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP3P42574 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP3P42574 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP3P42574 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP3P42574 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP3P42574 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP3P42574 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP3P42574 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP3P42574 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP3P42574 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP3P42574 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP3P42574 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP3P42574 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP3P42574 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP3P42574 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP3P42574 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP3P42574 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP3P42574 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP3P42574 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP3P42574 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms