Protein–RNA interactions for Protein: P38358

VBA2, Vacuolar basic amino acid transporter 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA2P38358 IPL1YPL209C 1104 nt7.28□□□□□ -1.24
VBA2P38358 BUB2YMR055C 921 nt7.27□□□□□ -1.25
VBA2P38358 NSG2YNL156C 900 nt7.26□□□□□ -1.25
VBA2P38358 MEX67YPL169C 1800 nt7.25□□□□□ -1.25
VBA2P38358 LEA1YPL213W 717 nt7.25□□□□□ -1.25
VBA2P38358 SRP102YKL154W 735 nt7.24□□□□□ -1.25
VBA2P38358 YTH1YPR107C 627 nt7.24□□□□□ -1.25
VBA2P38358 SRM1YGL097W 1449 nt7.24□□□□□ -1.25
VBA2P38358 YLR072WYLR072W 2082 nt7.24□□□□□ -1.25
VBA2P38358 YBR056WYBR056W 1506 nt7.23□□□□□ -1.25
VBA2P38358 YLR280CYLR280C 351 nt7.23□□□□□ -1.25
VBA2P38358 YCR025CYCR025C 411 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA2P38358 CHS7YHR142W 951 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA2P38358 HIS3YOR202W 663 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA2P38358 OLA1YBR025C 1185 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA2P38358 FTH1YBR207W 1398 nt7.21□□□□□ -1.25
VBA2P38358 URH1YDR400W 1023 nt7.21□□□□□ -1.26
VBA2P38358 SEN2YLR105C 1134 nt7.21□□□□□ -1.26
VBA2P38358 LCP5YER127W 1074 nt7.2□□□□□ -1.26
VBA2P38358 DUR3YHL016C 2208 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA2P38358 FAF1YIL019W 1041 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA2P38358 ERO1YML130C 1692 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA2P38358 MEP1YGR121C 1479 nt7.18□□□□□ -1.26
VBA2P38358 YJL064WYJL064W 396 nt7.18□□□□□ -1.26
VBA2P38358 NDE2YDL085W 1638 nt7.18□□□□□ -1.26
VBA2P38358 MET22YOL064C 1074 nt7.17□□□□□ -1.26
VBA2P38358 NAP1YKR048C 1254 nt7.16□□□□□ -1.26
VBA2P38358 snR4snR4 186 nt7.16□□□□□ -1.26
VBA2P38358 ABP1YCR088W 1779 nt7.15□□□□□ -1.26
VBA2P38358 SER2YGR208W 930 nt7.15□□□□□ -1.26
VBA2P38358 PAU19YMR325W 375 nt7.15□□□□□ -1.26
VBA2P38358 MDL2YPL270W 2322 nt7.15□□□□□ -1.27
VBA2P38358 BUD31YCR063W 474 nt7.14□□□□□ -1.27
VBA2P38358 YNL140CYNL140C 570 nt7.14□□□□□ -1.27
VBA2P38358 SNU66YOR308C 1764 nt7.14□□□□□ -1.27
VBA2P38358 HTS1YPR033C 1641 nt7.14□□□□□ -1.27
VBA2P38358 TIF3YPR163C 1311 nt7.14□□□□□ -1.27
VBA2P38358 INO1YJL153C 1602 nt7.13□□□□□ -1.27
VBA2P38358 DIA4YHR011W 1341 nt7.13□□□□□ -1.27
VBA2P38358 TDA4YJR116W 840 nt7.13□□□□□ -1.27
VBA2P38358 RNA170RNA170 169 nt7.13□□□□□ -1.27
VBA2P38358 TOM71YHR117W 1920 nt7.13□□□□□ -1.27
VBA2P38358 OCH1YGL038C 1443 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA2P38358 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA2P38358 YGR210CYGR210C 1236 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA2P38358 YMR166CYMR166C 1107 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA2P38358 PDC6YGR087C 1692 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA2P38358 EHT1YBR177C 1356 nt7.11□□□□□ -1.27
VBA2P38358 GLY1YEL046C 1164 nt7.11□□□□□ -1.27
VBA2P38358 YGR137WYGR137W 375 nt7.11□□□□□ -1.27
VBA2P38358 INM1YHR046C 888 nt7.11□□□□□ -1.27
VBA2P38358 TGL5YOR081C 2250 nt7.11□□□□□ -1.27
VBA2P38358 PUS5YLR165C 765 nt7.1□□□□□ -1.27
VBA2P38358 ADE16YLR028C 1776 nt7.1□□□□□ -1.27
VBA2P38358 CAK1YFL029C 1107 nt7.09□□□□□ -1.27
VBA2P38358 RCF1YML030W 480 nt7.09□□□□□ -1.27
VBA2P38358 RTG2YGL252C 1767 nt7.09□□□□□ -1.27
VBA2P38358 LRO1YNR008W 1986 nt7.08□□□□□ -1.28
VBA2P38358 ADE2YOR128C 1716 nt7.08□□□□□ -1.28
VBA2P38358 RRT14YIL127C 621 nt7.08□□□□□ -1.28
VBA2P38358 RHO1YPR165W 630 nt7.08□□□□□ -1.28
VBA2P38358 WSC3YOL105C 1671 nt7.07□□□□□ -1.28
VBA2P38358 YPL108WYPL108W 507 nt7.07□□□□□ -1.28
VBA2P38358 YPT31YER031C 672 nt7.06□□□□□ -1.28
VBA2P38358 LSP1YPL004C 1026 nt7.06□□□□□ -1.28
VBA2P38358 POP2YNR052C 1302 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA2P38358 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA2P38358 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA2P38358 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA2P38358 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA2P38358 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA2P38358 PUP3YER094C 618 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA2P38358 YLR122CYLR122C 378 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA2P38358 MRN1YPL184C 1839 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA2P38358 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA2P38358 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA2P38358 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA2P38358 KDX1YKL161C 1302 nt7.04□□□□□ -1.28
VBA2P38358 FIT1YDR534C 1587 nt7.04□□□□□ -1.28
VBA2P38358 THI73YLR004C 1572 nt7.04□□□□□ -1.28
VBA2P38358 DIP5YPL265W 1827 nt7.04□□□□□ -1.28
VBA2P38358 MLS1YNL117W 1665 nt7.04□□□□□ -1.28
VBA2P38358 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.03□□□□□ -1.28
VBA2P38358 MRP7YNL005C 1116 nt7.03□□□□□ -1.28
VBA2P38358 GCD11YER025W 1584 nt7.03□□□□□ -1.28
VBA2P38358 DUS3YLR401C 2007 nt7.02□□□□□ -1.29
VBA2P38358 YCP4YCR004C 744 nt7.02□□□□□ -1.29
VBA2P38358 FHN1YGR131W 525 nt7.02□□□□□ -1.29
VBA2P38358 FCY1YPR062W 477 nt7.02□□□□□ -1.29
VBA2P38358 KTR4YBR199W 1395 nt7.02□□□□□ -1.29
VBA2P38358 UFD1YGR048W 1086 nt7.01□□□□□ -1.29
VBA2P38358 TOM20YGR082W 552 nt7.01□□□□□ -1.29
VBA2P38358 ARA2YMR041C 1008 nt7.01□□□□□ -1.29
VBA2P38358 MDH2YOL126C 1134 nt7□□□□□ -1.29
VBA2P38358 PUP1YOR157C 786 nt7□□□□□ -1.29
VBA2P38358 PRE10YOR362C 867 nt7□□□□□ -1.29
VBA2P38358 SAM50YNL026W 1455 nt6.99□□□□□ -1.29
VBA2P38358 WSC4YHL028W 1818 nt6.99□□□□□ -1.29
VBA2P38358 CBK1YNL161W 2271 nt6.98□□□□□ -1.29
VBA2P38358 PFS2YNL317W 1398 nt6.98□□□□□ -1.29
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