Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPDP35247 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFTPDP35247 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPDP35247 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPDP35247 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms