Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSG3P32926 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSG3P32926 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DSG3P32926 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DSG3P32926 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DSG3P32926 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DSG3P32926 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DSG3P32926 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
DSG3P32926 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DSG3P32926 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DSG3P32926 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
DSG3P32926 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DSG3P32926 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DSG3P32926 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DSG3P32926 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DSG3P32926 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DSG3P32926 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DSG3P32926 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DSG3P32926 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DSG3P32926 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DSG3P32926 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DSG3P32926 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DSG3P32926 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DSG3P32926 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DSG3P32926 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DSG3P32926 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DSG3P32926 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
DSG3P32926 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DSG3P32926 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DSG3P32926 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DSG3P32926 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DSG3P32926 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
DSG3P32926 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DSG3P32926 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DSG3P32926 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DSG3P32926 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DSG3P32926 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSG3P32926 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DSG3P32926 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DSG3P32926 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
DSG3P32926 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DSG3P32926 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DSG3P32926 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DSG3P32926 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
DSG3P32926 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
DSG3P32926 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DSG3P32926 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DSG3P32926 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DSG3P32926 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DSG3P32926 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DSG3P32926 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DSG3P32926 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DSG3P32926 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DSG3P32926 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DSG3P32926 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DSG3P32926 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DSG3P32926 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DSG3P32926 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DSG3P32926 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DSG3P32926 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DSG3P32926 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DSG3P32926 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DSG3P32926 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DSG3P32926 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
DSG3P32926 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DSG3P32926 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DSG3P32926 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DSG3P32926 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DSG3P32926 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DSG3P32926 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DSG3P32926 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DSG3P32926 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DSG3P32926 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DSG3P32926 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DSG3P32926 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DSG3P32926 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DSG3P32926 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DSG3P32926 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DSG3P32926 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DSG3P32926 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DSG3P32926 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DSG3P32926 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DSG3P32926 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DSG3P32926 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DSG3P32926 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DSG3P32926 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DSG3P32926 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DSG3P32926 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DSG3P32926 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DSG3P32926 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DSG3P32926 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DSG3P32926 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DSG3P32926 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DSG3P32926 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DSG3P32926 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DSG3P32926 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DSG3P32926 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DSG3P32926 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DSG3P32926 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DSG3P32926 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms