Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTX2P32243 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTX2P32243 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTX2P32243 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTX2P32243 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTX2P32243 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTX2P32243 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTX2P32243 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTX2P32243 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTX2P32243 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTX2P32243 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTX2P32243 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTX2P32243 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTX2P32243 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTX2P32243 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTX2P32243 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTX2P32243 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTX2P32243 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTX2P32243 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTX2P32243 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTX2P32243 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
OTX2P32243 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTX2P32243 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTX2P32243 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTX2P32243 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
OTX2P32243 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTX2P32243 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTX2P32243 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTX2P32243 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTX2P32243 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
OTX2P32243 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTX2P32243 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTX2P32243 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
OTX2P32243 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OTX2P32243 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24■■□□□ 1.43
OTX2P32243 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTX2P32243 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTX2P32243 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTX2P32243 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTX2P32243 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTX2P32243 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTX2P32243 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTX2P32243 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTX2P32243 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTX2P32243 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTX2P32243 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTX2P32243 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTX2P32243 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTX2P32243 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
OTX2P32243 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTX2P32243 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTX2P32243 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTX2P32243 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTX2P32243 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTX2P32243 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTX2P32243 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTX2P32243 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTX2P32243 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTX2P32243 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTX2P32243 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTX2P32243 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTX2P32243 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTX2P32243 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTX2P32243 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTX2P32243 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTX2P32243 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OTX2P32243 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTX2P32243 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTX2P32243 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTX2P32243 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTX2P32243 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTX2P32243 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTX2P32243 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTX2P32243 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTX2P32243 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTX2P32243 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTX2P32243 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTX2P32243 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTX2P32243 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
OTX2P32243 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTX2P32243 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
OTX2P32243 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTX2P32243 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTX2P32243 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTX2P32243 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTX2P32243 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTX2P32243 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTX2P32243 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTX2P32243 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTX2P32243 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTX2P32243 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTX2P32243 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTX2P32243 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTX2P32243 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTX2P32243 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTX2P32243 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTX2P32243 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTX2P32243 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTX2P32243 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTX2P32243 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms