Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC1P29353 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHC1P29353 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHC1P29353 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC1P29353 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC1P29353 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC1P29353 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC1P29353 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC1P29353 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC1P29353 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC1P29353 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC1P29353 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHC1P29353 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHC1P29353 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHC1P29353 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHC1P29353 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHC1P29353 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHC1P29353 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHC1P29353 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHC1P29353 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHC1P29353 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHC1P29353 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHC1P29353 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHC1P29353 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHC1P29353 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHC1P29353 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHC1P29353 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHC1P29353 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHC1P29353 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHC1P29353 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHC1P29353 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHC1P29353 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHC1P29353 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHC1P29353 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHC1P29353 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHC1P29353 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHC1P29353 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHC1P29353 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHC1P29353 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHC1P29353 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHC1P29353 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHC1P29353 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHC1P29353 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHC1P29353 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHC1P29353 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHC1P29353 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHC1P29353 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHC1P29353 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHC1P29353 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHC1P29353 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SHC1P29353 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHC1P29353 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SHC1P29353 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHC1P29353 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHC1P29353 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHC1P29353 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHC1P29353 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHC1P29353 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHC1P29353 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHC1P29353 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHC1P29353 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHC1P29353 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHC1P29353 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SHC1P29353 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SHC1P29353 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHC1P29353 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHC1P29353 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHC1P29353 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHC1P29353 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHC1P29353 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHC1P29353 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHC1P29353 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHC1P29353 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHC1P29353 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHC1P29353 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHC1P29353 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHC1P29353 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHC1P29353 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHC1P29353 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHC1P29353 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHC1P29353 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHC1P29353 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHC1P29353 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHC1P29353 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHC1P29353 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHC1P29353 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHC1P29353 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHC1P29353 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHC1P29353 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHC1P29353 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHC1P29353 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHC1P29353 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHC1P29353 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHC1P29353 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHC1P29353 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHC1P29353 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHC1P29353 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHC1P29353 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHC1P29353 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SHC1P29353 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms