Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB5P28074 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMB5P28074 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB5P28074 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMB5P28074 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMB5P28074 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMB5P28074 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms