Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPA1P27694 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPA1P27694 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPA1P27694 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPA1P27694 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPA1P27694 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPA1P27694 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPA1P27694 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPA1P27694 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPA1P27694 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPA1P27694 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPA1P27694 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPA1P27694 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPA1P27694 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPA1P27694 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPA1P27694 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPA1P27694 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPA1P27694 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RPA1P27694 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPA1P27694 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPA1P27694 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPA1P27694 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPA1P27694 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPA1P27694 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPA1P27694 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RPA1P27694 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPA1P27694 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPA1P27694 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPA1P27694 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPA1P27694 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPA1P27694 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPA1P27694 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPA1P27694 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RPA1P27694 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPA1P27694 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RPA1P27694 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPA1P27694 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPA1P27694 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPA1P27694 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPA1P27694 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPA1P27694 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPA1P27694 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPA1P27694 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPA1P27694 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPA1P27694 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPA1P27694 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPA1P27694 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPA1P27694 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPA1P27694 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RPA1P27694 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RPA1P27694 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RPA1P27694 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPA1P27694 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPA1P27694 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPA1P27694 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPA1P27694 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPA1P27694 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPA1P27694 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPA1P27694 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPA1P27694 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPA1P27694 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPA1P27694 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPA1P27694 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPA1P27694 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPA1P27694 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RPA1P27694 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPA1P27694 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPA1P27694 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPA1P27694 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPA1P27694 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA1P27694 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPA1P27694 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPA1P27694 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPA1P27694 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPA1P27694 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPA1P27694 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPA1P27694 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPA1P27694 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPA1P27694 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPA1P27694 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPA1P27694 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPA1P27694 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RPA1P27694 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPA1P27694 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPA1P27694 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms