Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP24386 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP24386 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP24386 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP24386 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP24386 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP24386 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP24386 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP24386 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP24386 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP24386 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP24386 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP24386 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP24386 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP24386 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP24386 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP24386 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP24386 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP24386 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP24386 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP24386 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP24386 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP24386 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP24386 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP24386 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP24386 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP24386 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP24386 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP24386 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP24386 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP24386 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP24386 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP24386 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP24386 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP24386 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP24386 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP24386 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP24386 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP24386 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP24386 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP24386 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP24386 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP24386 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP24386 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP24386 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP24386 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP24386 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP24386 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP24386 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP24386 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP24386 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP24386 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP24386 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP24386 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP24386 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP24386 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP24386 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP24386 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP24386 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP24386 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP24386 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP24386 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP24386 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP24386 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP24386 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP24386 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP24386 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP24386 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP24386 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP24386 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP24386 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP24386 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP24386 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP24386 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP24386 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP24386 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP24386 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP24386 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP24386 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP24386 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP24386 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP24386 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP24386 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP24386 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP24386 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP24386 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP24386 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP24386 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP24386 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP24386 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP24386 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP24386 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP24386 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP24386 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP24386 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP24386 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP24386 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP24386 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP24386 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP24386 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms