Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP11P24347 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP11P24347 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP11P24347 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP11P24347 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP11P24347 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP11P24347 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP11P24347 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP11P24347 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP11P24347 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP11P24347 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP11P24347 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP11P24347 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP11P24347 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP11P24347 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP11P24347 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP11P24347 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP11P24347 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP11P24347 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP11P24347 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP11P24347 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP11P24347 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP11P24347 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP11P24347 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP11P24347 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP11P24347 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP11P24347 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP11P24347 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP11P24347 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP11P24347 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP11P24347 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MMP11P24347 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP11P24347 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP11P24347 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP11P24347 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP11P24347 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP11P24347 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP11P24347 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP11P24347 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP11P24347 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP11P24347 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP11P24347 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP11P24347 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP11P24347 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP11P24347 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP11P24347 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP11P24347 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP11P24347 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP11P24347 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP11P24347 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP11P24347 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP11P24347 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP11P24347 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP11P24347 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP11P24347 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP11P24347 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP11P24347 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP11P24347 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP11P24347 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP11P24347 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP11P24347 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP11P24347 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP11P24347 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP11P24347 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP11P24347 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP11P24347 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP11P24347 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP11P24347 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP11P24347 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP11P24347 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP11P24347 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP11P24347 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP11P24347 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP11P24347 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP11P24347 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP11P24347 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP11P24347 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP11P24347 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP11P24347 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP11P24347 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP11P24347 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP11P24347 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP11P24347 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP11P24347 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP11P24347 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP11P24347 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP11P24347 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP11P24347 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP11P24347 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP11P24347 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP11P24347 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP11P24347 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP11P24347 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP11P24347 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP11P24347 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP11P24347 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP11P24347 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP11P24347 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP11P24347 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP11P24347 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms