Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
HRCP23327 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
HRCP23327 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
HRCP23327 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
HRCP23327 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
HRCP23327 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
HRCP23327 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
HRCP23327 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
HRCP23327 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
HRCP23327 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
HRCP23327 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
HRCP23327 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
HRCP23327 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
HRCP23327 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
HRCP23327 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
HRCP23327 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
HRCP23327 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
HRCP23327 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
HRCP23327 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
HRCP23327 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
HRCP23327 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
HRCP23327 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
HRCP23327 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
HRCP23327 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
HRCP23327 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
HRCP23327 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
HRCP23327 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
HRCP23327 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
HRCP23327 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
HRCP23327 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
HRCP23327 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
HRCP23327 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC39.6■■■■□ 3.93
HRCP23327 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
HRCP23327 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
HRCP23327 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
HRCP23327 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
HRCP23327 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
HRCP23327 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC39.58■■■■□ 3.93
HRCP23327 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
HRCP23327 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
HRCP23327 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
HRCP23327 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
HRCP23327 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
HRCP23327 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
HRCP23327 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
HRCP23327 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
HRCP23327 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
HRCP23327 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
HRCP23327 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
HRCP23327 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
HRCP23327 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
HRCP23327 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
HRCP23327 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
HRCP23327 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
HRCP23327 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
HRCP23327 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC39.48■■■■□ 3.91
HRCP23327 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
HRCP23327 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
HRCP23327 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
HRCP23327 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
HRCP23327 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
HRCP23327 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
HRCP23327 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
HRCP23327 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
HRCP23327 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
HRCP23327 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
HRCP23327 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
HRCP23327 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
HRCP23327 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
HRCP23327 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
HRCP23327 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
HRCP23327 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
HRCP23327 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
HRCP23327 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
HRCP23327 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
HRCP23327 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
HRCP23327 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.39■■■■□ 3.9
HRCP23327 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
HRCP23327 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
HRCP23327 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
HRCP23327 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
HRCP23327 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
HRCP23327 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
HRCP23327 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
HRCP23327 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
HRCP23327 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
HRCP23327 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
HRCP23327 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
HRCP23327 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
HRCP23327 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
HRCP23327 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
HRCP23327 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
HRCP23327 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
HRCP23327 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
HRCP23327 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
HRCP23327 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
HRCP23327 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
HRCP23327 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
HRCP23327 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
HRCP23327 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms