Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN1P21941 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN1P21941 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN1P21941 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN1P21941 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN1P21941 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN1P21941 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN1P21941 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN1P21941 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN1P21941 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN1P21941 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN1P21941 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MATN1P21941 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MATN1P21941 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MATN1P21941 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MATN1P21941 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MATN1P21941 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MATN1P21941 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MATN1P21941 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MATN1P21941 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MATN1P21941 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MATN1P21941 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN1P21941 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MATN1P21941 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN1P21941 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN1P21941 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MATN1P21941 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN1P21941 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN1P21941 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MATN1P21941 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN1P21941 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN1P21941 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN1P21941 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN1P21941 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN1P21941 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN1P21941 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN1P21941 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN1P21941 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN1P21941 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN1P21941 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN1P21941 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN1P21941 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN1P21941 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN1P21941 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN1P21941 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MATN1P21941 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MATN1P21941 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN1P21941 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN1P21941 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN1P21941 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN1P21941 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN1P21941 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN1P21941 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MATN1P21941 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MATN1P21941 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MATN1P21941 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MATN1P21941 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MATN1P21941 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN1P21941 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN1P21941 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN1P21941 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN1P21941 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN1P21941 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN1P21941 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MATN1P21941 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MATN1P21941 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN1P21941 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN1P21941 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN1P21941 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN1P21941 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN1P21941 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN1P21941 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN1P21941 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN1P21941 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN1P21941 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN1P21941 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN1P21941 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN1P21941 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MATN1P21941 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MATN1P21941 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MATN1P21941 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MATN1P21941 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MATN1P21941 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN1P21941 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN1P21941 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN1P21941 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN1P21941 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN1P21941 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN1P21941 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN1P21941 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN1P21941 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN1P21941 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN1P21941 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN1P21941 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN1P21941 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN1P21941 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN1P21941 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN1P21941 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN1P21941 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN1P21941 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms