Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFNA1P20827 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFNA1P20827 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms