Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-DPA1P20036 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-DPA1P20036 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DPA1P20036 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DPA1P20036 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DPA1P20036 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DPA1P20036 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DPA1P20036 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DPA1P20036 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms