Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMY2BP19961 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMY2BP19961 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMY2BP19961 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms