Protein–RNA interactions for Protein: P17612

PRKACA, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACAP17612 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKACAP17612 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKACAP17612 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKACAP17612 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms