Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYN1P17600 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYN1P17600 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYN1P17600 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYN1P17600 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYN1P17600 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYN1P17600 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYN1P17600 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYN1P17600 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYN1P17600 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYN1P17600 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYN1P17600 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYN1P17600 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYN1P17600 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYN1P17600 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYN1P17600 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYN1P17600 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYN1P17600 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYN1P17600 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYN1P17600 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYN1P17600 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYN1P17600 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYN1P17600 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYN1P17600 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYN1P17600 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYN1P17600 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SYN1P17600 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYN1P17600 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYN1P17600 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYN1P17600 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYN1P17600 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYN1P17600 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYN1P17600 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYN1P17600 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYN1P17600 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYN1P17600 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYN1P17600 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYN1P17600 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYN1P17600 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYN1P17600 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYN1P17600 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYN1P17600 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYN1P17600 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYN1P17600 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SYN1P17600 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYN1P17600 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYN1P17600 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYN1P17600 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYN1P17600 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYN1P17600 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYN1P17600 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYN1P17600 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYN1P17600 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYN1P17600 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYN1P17600 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYN1P17600 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYN1P17600 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYN1P17600 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYN1P17600 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYN1P17600 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYN1P17600 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYN1P17600 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SYN1P17600 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYN1P17600 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYN1P17600 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYN1P17600 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYN1P17600 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYN1P17600 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYN1P17600 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SYN1P17600 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SYN1P17600 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYN1P17600 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYN1P17600 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYN1P17600 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYN1P17600 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYN1P17600 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYN1P17600 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYN1P17600 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYN1P17600 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYN1P17600 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYN1P17600 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYN1P17600 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYN1P17600 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYN1P17600 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYN1P17600 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYN1P17600 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYN1P17600 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYN1P17600 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYN1P17600 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYN1P17600 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SYN1P17600 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SYN1P17600 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYN1P17600 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYN1P17600 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYN1P17600 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYN1P17600 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYN1P17600 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYN1P17600 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYN1P17600 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYN1P17600 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms