Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF2P15336 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF2P15336 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF2P15336 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF2P15336 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF2P15336 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF2P15336 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF2P15336 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF2P15336 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF2P15336 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF2P15336 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF2P15336 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF2P15336 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF2P15336 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF2P15336 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF2P15336 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF2P15336 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF2P15336 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF2P15336 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF2P15336 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF2P15336 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF2P15336 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF2P15336 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF2P15336 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF2P15336 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF2P15336 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF2P15336 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF2P15336 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF2P15336 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF2P15336 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF2P15336 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF2P15336 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF2P15336 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF2P15336 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF2P15336 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF2P15336 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF2P15336 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF2P15336 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF2P15336 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ATF2P15336 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF2P15336 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF2P15336 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF2P15336 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF2P15336 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF2P15336 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF2P15336 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF2P15336 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF2P15336 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF2P15336 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF2P15336 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF2P15336 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF2P15336 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF2P15336 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF2P15336 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF2P15336 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF2P15336 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF2P15336 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF2P15336 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF2P15336 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATF2P15336 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATF2P15336 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF2P15336 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF2P15336 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF2P15336 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF2P15336 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF2P15336 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF2P15336 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF2P15336 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF2P15336 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF2P15336 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF2P15336 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF2P15336 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF2P15336 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF2P15336 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF2P15336 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF2P15336 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF2P15336 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF2P15336 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF2P15336 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF2P15336 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATF2P15336 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF2P15336 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF2P15336 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF2P15336 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF2P15336 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF2P15336 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF2P15336 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF2P15336 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF2P15336 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF2P15336 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF2P15336 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF2P15336 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF2P15336 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF2P15336 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF2P15336 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF2P15336 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF2P15336 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF2P15336 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF2P15336 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF2P15336 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms