Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB1P14653 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB1P14653 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms