Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNT1P13805 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNT1P13805 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNNT1P13805 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNT1P13805 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms