Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RD3LP0DJH9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RD3LP0DJH9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RD3LP0DJH9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms