Protein–RNA interactions for Protein: P06331

IGHV4-34, Immunoglobulin heavy variable 4-34, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV4-34P06331 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGHV4-34P06331 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IGHV4-34P06331 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGHV4-34P06331 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGHV4-34P06331 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGHV4-34P06331 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGHV4-34P06331 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGHV4-34P06331 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHV4-34P06331 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHV4-34P06331 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHV4-34P06331 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGHV4-34P06331 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHV4-34P06331 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IGHV4-34P06331 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHV4-34P06331 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms