Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB1P05556 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB1P05556 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB1P05556 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB1P05556 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB1P05556 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB1P05556 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB1P05556 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB1P05556 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB1P05556 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB1P05556 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB1P05556 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB1P05556 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB1P05556 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB1P05556 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB1P05556 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB1P05556 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms