Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SERPIND1P05546 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPIND1P05546 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPIND1P05546 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms