Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF2P04141 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF2P04141 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF2P04141 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF2P04141 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF2P04141 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF2P04141 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2P04141 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2P04141 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2P04141 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2P04141 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF2P04141 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF2P04141 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF2P04141 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF2P04141 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF2P04141 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF2P04141 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF2P04141 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF2P04141 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF2P04141 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF2P04141 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF2P04141 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF2P04141 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF2P04141 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF2P04141 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF2P04141 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF2P04141 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF2P04141 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF2P04141 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF2P04141 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF2P04141 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF2P04141 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF2P04141 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF2P04141 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF2P04141 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF2P04141 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF2P04141 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF2P04141 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF2P04141 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF2P04141 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF2P04141 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF2P04141 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF2P04141 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF2P04141 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF2P04141 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF2P04141 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF2P04141 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF2P04141 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF2P04141 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF2P04141 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF2P04141 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF2P04141 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF2P04141 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2P04141 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2P04141 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2P04141 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF2P04141 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF2P04141 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF2P04141 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF2P04141 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF2P04141 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF2P04141 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF2P04141 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF2P04141 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF2P04141 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF2P04141 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF2P04141 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF2P04141 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2P04141 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2P04141 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2P04141 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2P04141 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF2P04141 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF2P04141 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF2P04141 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF2P04141 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF2P04141 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF2P04141 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2P04141 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2P04141 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2P04141 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2P04141 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2P04141 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2P04141 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2P04141 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2P04141 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2P04141 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2P04141 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSF2P04141 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSF2P04141 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSF2P04141 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSF2P04141 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF2P04141 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF2P04141 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF2P04141 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF2P04141 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2P04141 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2P04141 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2P04141 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2P04141 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms