Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHA1P01876 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHA1P01876 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHA1P01876 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHA1P01876 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHA1P01876 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHA1P01876 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHA1P01876 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHA1P01876 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms