Protein–RNA interactions for Protein: P01138

NGF, Beta-nerve growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFP01138 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFP01138 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFP01138 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFP01138 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFP01138 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFP01138 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFP01138 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFP01138 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFP01138 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFP01138 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NGFP01138 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NGFP01138 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NGFP01138 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NGFP01138 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NGFP01138 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NGFP01138 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NGFP01138 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NGFP01138 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NGFP01138 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NGFP01138 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NGFP01138 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NGFP01138 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NGFP01138 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NGFP01138 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NGFP01138 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NGFP01138 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NGFP01138 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NGFP01138 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFP01138 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFP01138 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFP01138 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFP01138 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFP01138 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NGFP01138 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NGFP01138 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NGFP01138 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NGFP01138 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NGFP01138 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NGFP01138 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NGFP01138 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NGFP01138 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFP01138 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFP01138 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFP01138 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFP01138 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFP01138 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFP01138 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFP01138 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NGFP01138 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NGFP01138 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NGFP01138 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NGFP01138 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NGFP01138 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NGFP01138 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NGFP01138 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NGFP01138 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NGFP01138 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NGFP01138 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NGFP01138 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NGFP01138 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGFP01138 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGFP01138 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NGFP01138 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGFP01138 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGFP01138 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGFP01138 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFP01138 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFP01138 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFP01138 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFP01138 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFP01138 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFP01138 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFP01138 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFP01138 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFP01138 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFP01138 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGFP01138 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGFP01138 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGFP01138 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NGFP01138 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGFP01138 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGFP01138 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGFP01138 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGFP01138 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGFP01138 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGFP01138 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NGFP01138 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NGFP01138 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NGFP01138 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NGFP01138 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NGFP01138 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NGFP01138 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NGFP01138 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NGFP01138 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NGFP01138 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFP01138 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFP01138 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFP01138 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFP01138 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFP01138 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms