Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRUB2O95900 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRUB2O95900 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRUB2O95900 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRUB2O95900 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRUB2O95900 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRUB2O95900 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRUB2O95900 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRUB2O95900 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRUB2O95900 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRUB2O95900 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRUB2O95900 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRUB2O95900 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRUB2O95900 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRUB2O95900 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRUB2O95900 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRUB2O95900 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRUB2O95900 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms