Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF12O95522 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF12O95522 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF12O95522 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF12O95522 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms