Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX4O95219 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX4O95219 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX4O95219 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX4O95219 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX4O95219 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX4O95219 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX4O95219 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX4O95219 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX4O95219 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX4O95219 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX4O95219 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX4O95219 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX4O95219 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX4O95219 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX4O95219 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX4O95219 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX4O95219 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX4O95219 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX4O95219 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX4O95219 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX4O95219 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX4O95219 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX4O95219 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX4O95219 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX4O95219 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX4O95219 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX4O95219 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX4O95219 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX4O95219 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX4O95219 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX4O95219 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX4O95219 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX4O95219 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX4O95219 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX4O95219 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX4O95219 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX4O95219 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX4O95219 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX4O95219 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX4O95219 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX4O95219 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX4O95219 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX4O95219 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX4O95219 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX4O95219 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX4O95219 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX4O95219 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX4O95219 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX4O95219 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX4O95219 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX4O95219 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX4O95219 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX4O95219 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX4O95219 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX4O95219 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX4O95219 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX4O95219 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX4O95219 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX4O95219 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX4O95219 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX4O95219 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX4O95219 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX4O95219 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX4O95219 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX4O95219 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX4O95219 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX4O95219 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX4O95219 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX4O95219 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX4O95219 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX4O95219 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX4O95219 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX4O95219 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX4O95219 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX4O95219 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX4O95219 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX4O95219 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX4O95219 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX4O95219 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX4O95219 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX4O95219 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX4O95219 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX4O95219 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX4O95219 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX4O95219 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX4O95219 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX4O95219 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX4O95219 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX4O95219 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX4O95219 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX4O95219 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX4O95219 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX4O95219 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX4O95219 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX4O95219 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX4O95219 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX4O95219 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX4O95219 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX4O95219 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms