Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBE4BO95155 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE4BO95155 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE4BO95155 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE4BO95155 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE4BO95155 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE4BO95155 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE4BO95155 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE4BO95155 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE4BO95155 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBE4BO95155 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE4BO95155 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE4BO95155 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms