Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM37O94972 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM37O94972 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRIM37O94972 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM37O94972 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM37O94972 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM37O94972 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM37O94972 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM37O94972 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM37O94972 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM37O94972 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM37O94972 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM37O94972 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM37O94972 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM37O94972 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM37O94972 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM37O94972 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM37O94972 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM37O94972 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
TRIM37O94972 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TRIM37O94972 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TRIM37O94972 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM37O94972 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.81■■■■□ 3
TRIM37O94972 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM37O94972 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM37O94972 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM37O94972 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM37O94972 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM37O94972 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM37O94972 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM37O94972 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM37O94972 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRIM37O94972 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM37O94972 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM37O94972 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM37O94972 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM37O94972 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM37O94972 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms