Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRPM2O94759 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRPM2O94759 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRPM2O94759 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRPM2O94759 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
TRPM2O94759 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.61
TRPM2O94759 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
TRPM2O94759 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRPM2O94759 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRPM2O94759 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRPM2O94759 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
TRPM2O94759 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRPM2O94759 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRPM2O94759 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TRPM2O94759 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
TRPM2O94759 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRPM2O94759 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TRPM2O94759 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TRPM2O94759 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRPM2O94759 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRPM2O94759 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRPM2O94759 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRPM2O94759 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TRPM2O94759 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms