Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEBLO76041 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEBLO76041 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NEBLO76041 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEBLO76041 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEBLO76041 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEBLO76041 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEBLO76041 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEBLO76041 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEBLO76041 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEBLO76041 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEBLO76041 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEBLO76041 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEBLO76041 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEBLO76041 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEBLO76041 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEBLO76041 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEBLO76041 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEBLO76041 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEBLO76041 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEBLO76041 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEBLO76041 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEBLO76041 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEBLO76041 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NEBLO76041 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEBLO76041 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEBLO76041 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEBLO76041 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEBLO76041 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEBLO76041 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEBLO76041 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEBLO76041 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEBLO76041 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEBLO76041 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEBLO76041 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEBLO76041 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEBLO76041 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEBLO76041 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEBLO76041 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEBLO76041 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEBLO76041 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEBLO76041 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEBLO76041 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEBLO76041 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEBLO76041 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEBLO76041 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEBLO76041 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEBLO76041 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEBLO76041 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEBLO76041 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEBLO76041 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEBLO76041 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEBLO76041 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEBLO76041 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEBLO76041 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEBLO76041 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEBLO76041 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEBLO76041 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEBLO76041 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEBLO76041 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEBLO76041 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NEBLO76041 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEBLO76041 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEBLO76041 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEBLO76041 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEBLO76041 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEBLO76041 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEBLO76041 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEBLO76041 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NEBLO76041 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEBLO76041 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEBLO76041 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEBLO76041 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEBLO76041 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NEBLO76041 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEBLO76041 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEBLO76041 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEBLO76041 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEBLO76041 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEBLO76041 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEBLO76041 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEBLO76041 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEBLO76041 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEBLO76041 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEBLO76041 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEBLO76041 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEBLO76041 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEBLO76041 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEBLO76041 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEBLO76041 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEBLO76041 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEBLO76041 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NEBLO76041 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEBLO76041 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEBLO76041 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEBLO76041 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEBLO76041 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEBLO76041 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEBLO76041 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEBLO76041 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms